LABORATORIO DE ESTRUCTURA MOLECULAR
Jefe del Laboratorio:  Dr. Leonardo Mateu
Investigadores: Dr. Rodolfo Vargas
Posdoctorantes: Dra. Maria de Lourdes Borgo
Dra. Carmen Violeta Melendez
Profesionales de Apoyo a la Investigacion: Dra. Eva Vonasek
M. Sc. Gustavo Marquez
Tecnico de Apoyo a la Investigacion: Tec. Elec. Gilberto Sanchez
Indice: 
Líneas de Investigación
Química-Física de sistemas aceite-agua
Logros
Estructura y comportamiento de fases en sistemas lípido-agua y lípido-proteína-agua.
Estructura e Interacciones Moleculares entre Componentes de las Lipoproteínas de Plasma Humano. 
Estudio sobre la distribución de la litiasis renal en Venezuela.
La Química-Física de sistemas aceite-agua.
Publicaciones selectas

LINEAS DE INVESTIGACION
El Laboratorio de Estructura Molecular fue creado por el Consejo Directivo del IVIC en 1974. Inició sus actividades científicas investigando en tres temas principales en el campo de la Biología Estructural: 
) Determinar la Estructura Molecular de la Mielina con el mayor detalle espacial posible; 
) Estudiar la estructura y el comportamiento de fases en sistemas modelos lípido-agua y lípido-proteína-agua; 
) Estudiar la Estructura y las Interacciones Moleculares entre los Componentes de las Lipoproteínas de Plasma Humano. Más adelante, en 1984 iniciamos una nueva actividad investigativa: el estudio sobre la distribución de la litiasis renal en nuestro país. El haber incursionado con éxito en un problema aplicado como el de la litiasis nos motivó a ocuparnos de otros problemas aplicados que fueran importantes para el pais; es así como comenzamos a desarrollar técnicas para medir parámetros estructurales en procesos mas tecnológicos relacionados con la Química-Física de los sistemas aceite-agua, por la relevancia que pueden tener para nuestra industria petrolera. Haber podido trabajar en Biología Estructural en Venezuela, hace 25 años, fué posible gracias a que en aquel momento, en el IVIC se disponía de una serie de técnicas físicas sofisticadas tales como, la resonancia magnética nuclear, la microscopía electrónica y la resonancia paramagnética electrónica, así como facilidades en sus talleres para construir los equipos de difracción de rayos-X y de dispersión de rayos-X a ángulo bajo. Con el transcurrir del tiempo hemos podido mejorar notablemente estas últimas técnicas de manera original, al punto que hoy en día podemos hacer experimentos con mucha mayor rapidez y precisión.

La determinación de la Estructura Molecular de la Mielina es un tema importante per se por tratarse de una membrana biológica que se encuentra naturalmente ordenada, espiralmente enrollada alrededor de los axones en un arreglo repetitivo de más de 100 vueltas; esa característica permite estudiarla con técnicas cristalográficas (difracción de rayos-X) a la resolución espacial de unos 12 Ångstroms (un Ångstrom es la diezmillonésima parte de un milímetro). Otra característica importante de la mielina es que es posible extraer segmentos de nervios de animales de laboratorio en los que cada uno de esos nervios puede contener miles de axones con mielina en su interior. Estos nervios se conservan fisiológicamente activos aún después de ser extraidos, por lo que los resultados estructurales obtenidos son relevantes a una membrana biológica viva. A partir de alli, es posible tratar los nervios para ubicarlos en distintas condiciones fisiológicas y/o patológicas, lo que permite registrar simultaneamente los cambios estructurales producidos por distintos estímulos fisiológicos. Este constituye un sistema ideal para estudiar la relación estructura-función en membranas biológicas. Son significativos los logros que hemos obtenido en el laboratorio con el estudio básico de nervios de animales sometidos a diversos tratamientos; desde siempre nos han interesado los aspectos relacionados con la estabilidad de la mielina, en las posibles causas de su pérdida y en las consecuencias patológicas que esta conlleva. Desde hace unos 10 años, nuestros intereses en este campo han ido evolucionando hacia el estudio de la estructura y la función de nervios humanos en casos patológicos bien diagnosticados o en patologías inducidas en animales de laboratorio. Esta evolución ha tenido lugar gracias al gran avance que hemos hecho en el análisis de los espectros de rayos-X de mielina. En efecto, este sistema de análisis, adaptado para estudiar estructuras ordenadas unidimensionalmente, consiste en un conjunto de algoritmos matemáticos y su software asociado, el cual nos permite extraer, de manera rápida y precisa, un conjunto de parámetros estructurales de ordenamiento y también del desorden (ver detalles en logros), característicos del sistema lamelar que se esta estudiando. Con esta tecnología en la mano, es posible iniciar investigaciones en el campo de la neurología que afectan al ser humano, tales como el estudio de las diversas neuropatías humanas (en sistema nervioso central y periférico) así como la puesta a punto de modelos animales de esas neuropatías para ensayar el mejoramiento de terapias que puedan eventualmente ayudar a sanar más rápidamente a las personas que padecen esas enfermedades. Otro punto de interés en este tema es el relacionado con el desarrollo del sistema nervioso usando las medidas de cantidad y calidad de mielina como indicador de desarrollo. Un aspecto importante relacionado con esta idea es el estudio de la desnutrición en la evolución del sistema nervioso periférico y central y su posible reversión mediante dietas apropiadas que permitan a individuos desnutridos alcanzar los niveles de desarrollo normales de su sistema nervioso.

Mediante el estudio de la estructura y el comportamiento de fases en sistemas lípido-agua y lípido-proteína-agua pretendemos mimetizar algunas de las propiedades fisiológicas de los sistemas biológicos que contienen lípidos, tales como las membranas y las lipoproteínas de plasma, para poder estudiarlas con mayor profundidad en esos sistemas modelos de composición simple en donde todos los parámetros están bien definidos. Para poder realizar esas investigaciones es necesario construir diagramas de fase de las diversas mezclas lipídicas en una serie de condiciones previamente establecidas, por ejemplo temperatura, concentración, pH, etc., y determinar los dominios de existencia de las fases puras y de las mezclas; luego hay que determinar los tipos de arreglos estructurales de esas fases a largo rango, estableciendo si se trata de motivos que se repiten a una, dos o tres dimensiones, con sus simetrias respectivas. También se hace necesario cuantificar la cantidad de orden y desorden a corto rango, ya se trate de fases del tipo llamado sméctico (con desorden en dos dimensiones) o paracristalinas (con desorden rotacional de las moléculas).

El estudio de la Estructura e Interacciones Moleculares entre Componentes de las Lipoproteínas de Plasma Humano fué un tema de investigación favorito en el laboratorio hasta el año 1984. Para comenzar, tuvimos que construir la cámara de dispersión de rayos-X a bajo ángulo;aplicando esa técnica estudiamos inicialmente muestras de lipoproteínas en solución provenientes de los diversos bancos de sangre del país y de individuos específicos, con énfasis especial en la determinación de la estructura de las moléculas de baja (LDL) y de alta densidad (HDL) con el objeto de establecer la ubicación, en el interior de esas partículas, de cada una de las clases de componentes: ésteres de colesterol, colesterol, fosfolípidos y proteínas. Luego, gracias a una colaboración iniciada con el laboratorio de lipoproteínas del Centro de Biofísica y Bioquímica se amplió nuestro campo de interés hacia el estudio de la estructura de muestras de LDL provenientes de enfermos con problemas cardiovasculares, asi como al estudio estructural de las interacciones de las LDL con moléculas de pared arterial y a la estabilidad de dicha interacción. Ya mas adelante, iniciamos un proyecto que apuntaba a desarrollar un sistema para cuantificar el porcentaje de cualquier muestra de LDL que a la temperatura fisiológica (37 0C), se encontrase en una conformación quasi-cristalina, la cual es mas adecuada para interaccionar con moléculas de íntima media arterial. Esto podría permitir, tal vez, diagnosticar en un individuo cualquiera el porcentaje de sus LDL que fuesen potencialmente más patológicas , como una información adicional al perfil lipídico que los pacientes se hacen de rutina.


Química-Física de sistemas aceite-agua
La técnica que hemos usamos para los estudios de moléculas en solución es la dispersión de rayos-X a bajo ángulo, con la cual no solamente estamos estudiando sistemas modelos lípido-agua de relevancia biológica, sino que es posible usarlas para caracterizar estructuralmente algunos procesos tecnológicos en nuestra industria petrolera y aún de la industria farmaceútica. Mediante la técnica de dispersión de rayos-X a bajo ángulo, cuyos aspectos teóricos conocemos con cierta profundidad y cuyo instrumental hemos diseñado y construido en el laboratorio, es posible determinar características tales como la forma (laminar, cilíndrica, esférica, elipsoidal de varios tipos, etc.) y la distribución de tamaños en muestras de suspensiones micelares.
Distribución por sexo de los cálculos analizados en el laboratorio provenientes de los diversos Estados de Venezuela

LOGROS
La Estructura Molecular de la Mielina. Nuestros hallazgos en este tema han sido los siguientes:
) Hemos encontrado que un defecto de cationes divalentes en el medio de incubación de los nervios, produce la desestabilización del arreglo periódico de las membranas de mielina a nivel de la aposición de las caras externas.
) Hemos encontrado que la propagación repetida de potenciales de acción tiene un efecto desestabilizante similar al producido por la depleción de los cationes divalentes. Dicho efecto desestabilizador es debido primariamente a que la mielina paranodal se hace mas laxa.
) Se puso a punto un sistema experimental para estudiar nervios de ranas in vivo, mediante el cual se determinaron los efectos de la compresión mecánica localizada de nervios in vivo y el efecto de la inhalación de anestésicos generales in vivo los cuales actúan engrosando las membranas.
) Se pusieron a punto una serie de algoritmos matemáticos y el software asociado para analizar espectros de difracción de rayos-X de sistemas periódicos unidimensionales (mielina en este caso). La información producida al final del análisis es la siguiente: D, distancia de repetición del par de membranas que se enrollan en espiral y su varianza sD; <N>, número de pares de membranas que rodean los axones, en promedio en todo el nervio; amyel, porcentaje de mielinización total; aloose, fracción de mielina que se encuentra desordenada en el paranodo y el internodo; imotif(s), intensidad difractada por la doble membrana y r(r), perfil de densidad electrónica, que son un par de transformadas de Fourier recíprocas.
) Hemos estudiado la cinética de desestabilización de la mielina en una serie de condiciones fisiológicas y/o patológicas.
) Se estableció el mecanismo estructural de la mielinogénesis en el sistema nervioso central y periférico de ratas.
) Se pudo determinar que los anestésicos locales actuan engrosando las membranas de mielina y además, separándolas a nivel del espacio citoplásmatico.
) Se pudo precisar que el efecto de la temperatura consiste en engrosar (baja Temperatura) o estrechar (alta Temperatura) las membranas de mielina.
) El efecto estructural y funcional de la temperatura y de los anestésicos locales es prácticamente idéntico, lo cual nos ha permitido postular que el fenómeno de la disminución de la actividad eléctrica nerviosa en ambos tratamientos tiene una causa común: el engrosamiento de la doble capa lipídica.
10º) Sueros provenientes de ratas con Neuritis Alérgica Éxperimental (NAE) inyectados en nervios ciáticos de ratas sanas producen desmielinización, así hemos demostrado la transferencia pasiva de esta patología.
11º) Hemos establecido que la desnutricion proteico calórica influye de manera importante en el desarrollo del sistema nervioso central y periférico de ratas; no solamente en la disminución de la cantidad de mielina que rodea los axones, sino en que la estructura de esta es defectuosa comparada con controles normales. En este proyecto estamos tratando de establecer condiciones de reversibilidad que permitan que sujetos desnutridos recuperen las condiciones estructurales y fisiológicas de los individuos nutridos normalmente.
12º) Estudiamos unas 150 biopsias de nervios surales provenientes de otros tantos enfermos con neuropatías periféricas. Estamos construyendo un catálogo estructural de las diferentes patologías que llegan a la consulta de neurología del Hospital Universitario de Caracas, con el objeto de establecer el defecto molecular de cada una de esas enfermedades a un nivel de confianza tal, que nos permita usar los espectros de difracción de rayos-X con fines de diagnóstico. 

Experimentos de microscopia de luz y de difracción de rayos-x en nervios ciáticos de una rata sana (columna de la izquierda) comparados con una rata a la que se le ha inducido Neuritis Alérgica Experimental (columna de la izquierda). Observar en las micrografias la gran cantidad de mielina en la rata sana y la casi total ausencia de axones mielinizados en la rata enferma. Esta disminución de la cantidad de mielina se corresponde con la menor intensidad de los reflejos en el patrón de difracción de rayos-x de la rata enferma.

Estructura y comportamiento de fases en sistemas lípido-agua y lípido-proteína-agua.
) Hemos estudiado por una parte, la estructura de mezclas de fosfolípidos y colesterol en presencia de agua y por la otra de fosfolípidos y ergosterol. Descubrimos que a pesar de que ambos esteroles son estructuralmente muy parecidos, hay diferencias significativas entre el comportamiento de ambos sistemas en las fronteras de los diagramas de fase y en el dominio de existencia de las fases puras. Estos resultados constituyen el inicio para poder entender una serie de fenómenos fisiológicos que ocurren en organismos inferiores como hongos y tripanosomas en presencia de drogas capaces de destruirlos.
) Estudiando en función de la temperatura, la estructura de mezclas de monoglicéridos y agua con una serie de aditivos como colesterol y algunos fármacos que presentan actividad anestésica, llegamos a poner en evidencia fenómenos tales como la presencia estable de una fase con simetría cúbica Q229, la cual nunca antes se había podido obtener en forma estable. Lo anterior permitirá estudiarla con técnicas de microscopía para analizarlas posteriormente mediante el estudio computarizado de las imágenes.
) En los últimos años existe un gran interés por establecer métodos que permitan cristalizar las proteínas de membrana. Un grupo de investigadores suizos logró recientemente cristalizar la bacteriorhodopsina de la bacteria Halobacterium halobium en el interior de una estructura a simetría cúbica compuesta por monooleina y agua. Este resultado ha producido un gran revuelo en la comunidad científica internacional. Con el fin de tratar de standarizar una método general de cristalización de proteínas de membrana, nosotros hemos estudiado la estructura de mezclas de monoglicéridos en presencia de agentes cristalizadores de proteínas, para establecer el efecto estructural de esos agentes en la forma y la simetría de las fases cúbicas. Hasta el momento tenemos resultados que indican que es posible manejar a voluntad el tamaño de los poros acuosos de esas fases. Este proyecto está en pleno estudio actualmente.

Modelo estructural de la proteina de inclusion de virus en Bombyx mori formada por 6 triadas de 3 sub-unidades cada una (2 laterales y 1 central)

Estructura e Interacciones Moleculares entre Componentes de las Lipoproteínas de Plasma Humano. 
) Se diseño y construyó una cámara para dispersión de rayos-x en bajo ángulo la cual permite estudiar partículas en solución de tamaño hasta de 1000 Å de diámetro.
) Se estudiaron muestras de LDL provenientes de personas normales y de pacientes que habían tenido algún episodio cardiovascular reciente. Encontramos que la estructura interna de las LDL de enfermos era mucho más ordenada que la de los controles sanos.
) Demostramos que la conformación interna de las moléculas al interior de la LDL condiciona la estructura de la superficie y viceversa. Lanzamos la idea de que las LDL aisladas de plasma de enfermos, cuya estructura interna es quasi-cristalina a la temperatura fisiológica de 37 0C, tenían modificada la estructura de su superficie, lo cual las hacía mas afines por macromoléculas de pared arterial.
) Demostramos que la LDL acomplejada con macromoléculas de pared arterial disminuye significativamente su estabilidad estructural al punto de que en tiempos muy cortos (minutos) la partícula expulsa las moléculas hidrofóbicas que estan en su interior (colesterol, ésteres de colesterol y triglicéridos) poniendolas en contacto con el medio acuoso. Lo anterior tiene como consecuencia que debido al efecto hidrofóbico, se forme un germen de cristal líquido con el colesterol y sus ésteres, a partir del cual puede comenzar a crecer una placa.
) Demostramos que partículas de LDL sometidas a campos magnéticos mayores de siete (7) Tesla se orientan en ese campo produciendo espectros de difusión de rayos-X a mayor resolución que sin orientar, lo cual implica una mas detallada información estructural.
 
Fotografía de una muestra de arenillas renales de un paciente masculino de 40 años y patrón de difracción de rayos-X correspondiente. La interpretación del espectro indica que la muestra está compuesta en un 100 % por Acido Urico monohidratado.

Estudio sobre la distribución de la litiasis renal en Venezuela.
) Hemos desarrollado una tecnología original basada en la cristalografía de rayos-X, que nos permite analizar cálculos renales de muy pequeño tamaño (solamente de Un miligramo de peso) en tiempos muy cortos (Un minuto).
) Nos hemos constituido de hecho en el laboratorio nacional de análisis de cálculos renales.
) Estamos prestando un servicio al sector salud que antes no existía. Antes de 1984 los enfermos litiásicos con posibilidades económicas debían enviar sus cálculos a los Estados Unidos para que fuesen analizados por cristalografia de rayos-x, pero con los métodos convencionales que se usan en ese país, solamente es posible analizar aquellas muestras con un peso mayor de unos 20 miligramos; esta limitación dejaba de hecho sin posibilidad de analizar sus cálculos a aquellos pacientes, con pequeñas piedras expulsadas o con arenillas renales, los cuales constituyen la mayoría de la población. Esta población y la de bajos recursos económicos debía analizar sus muestras con métodos químicos convencionales, que han demostrado no ser precisos. Desde 1984 todos los enfermos de cálculos renales en Venezuela tienen acceso a nuestro servicio.
) Hemos organizado una base de datos con la información socioeconómica y con los resultados del análisis cristalográfico de unos 15.000 enfermos atendidos hasta el presente. Estos resultados, que aumentan día a día con los análisis que seguimos efectuando, serán publicados en el momento oportuno para uso del gremio de urólogos y nefrólogos del país.

 La Química-Física de sistemas aceite-agua.
 ) Se han hecho contribuciones a la caracterización de sistemas aceite-agua de interés tecnológico, tales como: emulsiones (liposomas y cubosomas como vehículos para drogas específicas) y mezclas que cristalizan.
) Hemos contribuido de manera fundamental a la cristalografía de los sistemas aceite-agua.
) Se ha contribuido a la caracterización de materiales meso y macroporosos para la Industria.
) Se han caracterizado cristalograficamente las estructuras de varias fases bicontínuas.
) Hemos contribuido de manera fundamental a la caracterización estructural de catalizadores de poro extra-ancho.
) Se han caracterizado estructuralmente muestras de crudos pesados y algunos derivados en el proceso de crackeo, provenientes de nuestra industria petrolera.

Publicaciones selectas:
1º) Caron, F., L. Mateu, P. Rigny and R. Azerad. Chain motions in lipid-water and protein-lipid water phases: A spin-label and X-ray diffraction study. Journal of Molecular Biology. 85: 279-300,1974.
2º) Stuhrmann, H.B., A. Tardieu, L. Mateu, C. Sardet, V. Luzzati, L. Aggerbeck and A.M. Scanu. Neutron scattering study of human serum low density lipoproteins. Proceedings of the National Academy of Sciences (U.S.A.). 72: No. 6, 2270-2273,1975
3º) Mateu, L., T. Kirchhausen, R. Padrón and G. Camejo. Small-angle X-ray scattering study of human serum low density lipoproteins with differential reactivity for an arterial proteoglycan. Journal of Supramolecular Structure. 7:435-442,1978.
4º) Morán, O. and L. Mateu. Loosening of paranodal myelin by the repetitive propagation of action potentials. Nature. 304:344-345, 1983.
5º) Mateu, L., E.M. Avila, G. Camejo, V. León and N. Liscano. The structural stability of low density lipoproteins: a kinetic x-ray scattering study of its interaction with arterial proteoglycans. Biochim. et Biophys. Acta. 795:525-534,1984.
6º) Mateu, L. La Mielina. Investigación y Ciencia, versión en castellano de Scientific American. 131:83-93,1987. 
7º) Vonasek, E., Morán, O. and Mateu, L. An X-ray diffraction study of changes in myelin structure during experimental allergic neuritis. J. of Neurocytol. 16:105-114,1987.
8º) Luzzati, V. and Mateu, L. Order-Disorder phenomena in myelinated nerve sheaths. I.- A physical model and its parametrization; exact and approximate determination of the parameters. Journal of Molecular Biology. 215:373-384,1990.
9º) Vargas, V., Vargas, R., Mateu, L. and Luzzati, V. The effects of malnutrition on the physical structure of developing rat sciatic myelin. Ann. New York Acad. Sc. 817:368-371,1997.
10º) Luzzati, V., Mateu, L., Marquez, G. & Borgo, M. Structural and electrophysiological effects of local anesthetics and of low temperature on myelinated nerves: implication of lipid chains in nerve excitability. Journal of Molecular Biology, 286:1389-1402, 1999.