LABORATORIO DE ESTRUCTURA SUPRAMOLECULAR


Jefe del Laboratorio:  Lic. lorenzo Alamo
Investigadores:

Dr. Raúl Padrón
Dra. Guidenn Sulbaran
Dra. Rosalva Rodríguez

Profesionales de Apoyo a la Investigacion:

Dr. Gustavo Marquéz
Lic. Lorenzo Alamo

Profesional de Apoyo a los Servicios: Ing. Antonio Pinto
Indice:
Líneas de Investigación
Logros
Publicaciones selectas
Reconstrucción tridimensional de filamento grueso de músculo estriado de tarántula (izquierda) y ajuste de la estructura cristalográfica de la molécula de miosina a dicha reconstrucción (derecha).

LINEAS DE INVESTIGACION
La característica básica de los animales es que se mueven. Este movimiento ocurre porque los animales tienen maquinas biológicas sofisticadas denominadas músculos las cuales son capaces de producir fuerza y trabajo, así como movimientos a velocidades muy precisas y controladas. Los músculos son maquinas moleculares capaces de convertir energía química derivada de los alimentos en fuerza mecánica. El mecanismo a nivel molecular por el cual este proceso de conversión ocurre y como se controla precisamente es un problema importante en Biología. Nosotros damos por sentado que los músculos de nuestros cuerpos están contrayéndose y relajándose continuamente durante nuestra vida diaria, y solo notamos su existencia cuando no funcionan bien. En efecto nuestros cuerpos están formados en una gran proporción por tejidos musculares y su movimiento coordinado es critico para nuestra salud. 
Como todos conocemos, si un músculo es estimulado eléctricamente se contrae y se acorta. Una pregunta que a preocupado a los científicos por un largo tiempo es como los músculos se acortan, contraen y producen fuerza y trabajo mecánico. Un músculo esquelético de un vertebrado como nosotros esta hecho de muchas células denominadas fibras las cuales son muy pequeñas, de 20 a 100 micrómetros (un micrómetro es la millonésima parte de un metro) de diámetro. Cada una de estas fibras musculares esta integrada por un conjunto de miofibrillas cilíndricas de solamente 1 a 2 micrómetros de diámetro. Dentro de cada una de estas miofibrillas hay pequeñas unidades denominadas sarcómeros, que son las unidades básicas de producción de fuerza similares a pequeños motores lineares, y que están integrados por la interdigitación de dos conjuntos de filamentos, conocidos como los filamentos gruesos, formados principalmente por la proteína miosina; y los filamentos delgados, formados básicamente por la proteína denominada actina. Cuando una señal transmitida por un nervio llega a un músculo dispara su contracción y acortamiento. Se ha descubierto que en efecto lo que ocurre es que la señal nerviosa produce un incremento en la concentración de iones de calcio en el interior de los sarcómeros, los cuales se acortan. La causa del acortamiento de los sarcómeros fue descubierto simultáneamente por Hugh Huxley y Jean Hanson, y por Andrew Huxley y Ralf Niedergerke, quienes demostraron que lo que ocurría durante la contracción y acortamiento era el deslizamiento de los dos conjuntos de filamentos uno en contra del otro, denominado el modelo de los filamentos deslizantes de la contracción.

Portada de la revista Journal of Structural Biology (volumen 115 numero 1, Julio-Agosto de 1995) mostrando la reconstruccion tridimensional de filamentos gruesos de músculo de tarántula tenidos negativamente, y substituidos bajo congelamiento; asi como el modelo atomico preliminar de la estructura de un filamento grueso de músculo.

De esta manera la pregunta macroscopica inicial de como un músculo de contrae, se acorta y se controla se traduce a una nueva pregunta microscópica de como la fuerza de deslizamiento entre ambos conjuntos de filamentos se genera y se controla. Para responder esta nueva pregunta es preciso ir un paso mas en el interior de la maquina muscular denominada sarcómero. Hugh Huxley descubrió que los filamentos gruesos están formados principalmente por una molécula de proteína denominada miosina. Cada molécula de miosina tiene una cola o bastón muy largo en un extremo y dos cabezas globulares en el otro extremo. Las colas o bastones se empacan entre si formando el núcleo o esqueleto del filamento, y las cabezas de miosina sobresalen en su superficie. El deslizamiento de los filamentos gruesos y delgados uno contra del otro ocurre cuando las cabezas de miosina se enlazan a las moléculas globulares de actina que forman los filamentos delgados, formando lo que Hugh Huxley denomino puentes cruzados, proceso este que ocurre de manera cíclica. Huxley denomino este proceso cíclico el ciclo de los puentes cruzados como una explicación de como un sarcómero se acortaba durante la contracción muscular: muchas cabezas de miosina de los filamentos gruesos se mueven fuera de la superficie y se enlazan a las moléculas adyacentes de actina en los filamentos delgados, cada una de ellas cambia de conformación y arrastra a los filamentos delgados produciendo el deslizamiento y acortamiento del sarcómero. Cada cabeza es un motor molecular independiente capaz de producir fuerza y deslizarse independientemente de los otros. De nuevo la pregunta incial que hicimos antes, primero a un nivel macroscópico, y luego a un nivel microscópico; la podemos ahora hacer a un nivel molecular: como estos motores moleculares, o cabezas de miosina, pueden producir fuerza y como esta se controla? Fue el descubrimiento de la estructura cristalográfica de la cabeza de miosina la que abrió las puertas para poder responder esta nueva pregunta.
Nosotros estamos tratando de comprender como se controla la contracción muscular al incrementarse la concentración de calcio. Específicamente estamos interesados en comprender por que en algunos músculos un incremento en la concentración de calcio libera las cabezas de miosina de la superficie del filamento, activándolos para estar listos para interaccionar con la actina para producir fuerza durante el ciclo de los puentes cruzados. Cada cabeza de miosina esta formada por tres cadenas polipeptídicas: una cadena pesada que forma la mayor parte de la cabeza globular, y dos cadenas ligeras, denominadas las cadenas ligeras esenciales y reguladora. Nosotros estamos estudiando un tipo particular de músculo estriado de las extremidades de las tarántulas en los cuales los cationes calcio se pueden acomplejar con el polipeptido calmodulina, el cual a su vez se acompleja con una quinasa especifica (conocida como la quinasa de la cadena ligera de la miosina QCLM) la cual puede fosforilar un aminoácido especifico de la cadena ligera reguladora (CLR) de la cabeza de miosina añadiéndole cargas negativas a ella. En estos músculos cuando la concentración de calcio es baja las cabezas de miosina están localizadas yaciendo sobre la superficie de los filamentos gruesos, formando hélices.

Portada de la revista Journal of Molecular Biology (volumen 275 numero 1, Enero 1998) mostrando el ajuste de las coordenadas atómicas de la molécula de miosina a la reconstrucción tridimensional de filamentos gruesos de músculo.

Nuestros estudios en comprender las bases moleculares de la activación de las cabezas de miosina de los filamentos gruesos puede ser de alguna importancia en vista de los recientes estudios hechos por la Dr. Rhea Levine y sus colegas (Department of Neurobiology and Anatomy, Allegheny University of Health Sciences, Philadelphia) sobre la enfermedad hereditaria denominada Cardiopatia Hipertrofica Familiar (CHF). Ellos estudiaron el efecto de una CLR mutante en la estructura y función del músculo esquelético lento deltoides obtenido de muestras de biopsias que expresaban al aminoácido lisina en lugar del aminoácido glutamato en el residuo #22 de la CLR de pacientes con CHF heredada, caracterizada por un engrosamiento anormal del músculo papilar del ventrículo izquierdo así como de la pared del ventrículo izquierdo y el septum ventricular. Sus resultados indican que la respuesta de los filamentos gruesos de pacientes con CHF es mas sensible a calcio y que sus cabezas de miosina están completamente desordenadas en la superficie de los filamentos gruesos. Por tanto la comprensión de las bases de como las hélices de las cabezas de miosina se forman y se mantienen, así como la manera como las cabezas de miosina se liberan y se desordenan pudiera ser de interes para comprender mas sobre esta y otras enfermedades musculares.
Nosotros estamos interesados en comprender las bases moleculares de como esta modulación ocurre, en otras palabras cuales son las razones por las cuales las cabezas de miosina se mantienen yaciendo sobre la superficie de los filamentos gruesos formando helices en condiciones de relajación, en presencia de ATP; y además porque la fosforilación de un aminoácido serina de la CLR ubicado cercano al cuello de la cabezas de miosina, induce la disrupción del arreglo en hélice y la liberación de las cabezas retenidas en la superficie del filamento.
El objetivo final de nuestra investigación es comprender los detalles del mecanismo molecular de como las cabezas de miosina forman hélices y como estas se desordenan cuando el músculo se activa debido a la fosforilación. Nuestros pasos futuros incluyen utilizar la crio-Microscopía Electrónica para examinar los filamentos gruesos para permitirnos obtener una resolución mayor que la anteriormente obtenida por tinción negativa. Luego estaremos en posición de determinar modelos atómicos mas confiables que podremos refinar contra los patrones de difracción de rayos-X obtenidos de músculo vivo. 


LOGROS
Nosotros hemos encontrado que cuando los músculos están en estado de reposo las cabezas de miosina se mantienen cercanas a la superficie del filamento grueso formando hélices, y que para que las hélices se formen se requiere la presencia de adenosintrifosfato (ATP). Nosotros hemos observado directamente filamentos gruesos aislados de músculo relajado usando el microscopio electrónico. De las micrografías Electrónicas hemos calculado una reconstrucción tridimensional que muestra la estructura de las cabezas de miosina en la superficie de los filamentos gruesos. Nosotros hemos posicionado visualmente la estructura atómica de la molécula de la cabeza de miosina sobre esta reconstrucción tridimensional obteniendo un modelo atómico preliminar del filamento grueso. Mas recientemente hemos desarrollado en colaboración con el Dr. Gerald Offer de Bristol University un procedimiento automático de ajuste tridimensional computarizado que nos permite construir modelos atómicos de los filamentos gruesos y determinar cual es el mejor posible modelo atómico
Nosotros también hemos encontrado que cuando se incrementa la concentración de los iones calcio, se produce la fosforilación de las CLR de la miosina, y que las cabezas de miosina se separan de la superficie del filamento grueso, desordenándose completamente, según se detecta por Microscopía Electrónica y por difracción de rayos-X.

Diagrama de modelo de filamento grueso de músculo propuesto por nosotros mostrando la disposición antiparalela de cabezas de miosina. (ver Darnell, Lodish y Baltimore: Molecular Cell Biology, Scientific American Books 1990).

Nosotros pensamos que en estos músculos esta fosforilación es una manera de modular el numero de cabezas de miosina que pueden ser activadas y estar listas para contracción. Cuando la concentración de calcio es baja, las cadenas ligeras reguladoras no están fosforiladas y los músculos están en estado relajado, en el que las cabezas de miosina se mantienen yaciendo sobre la superficie del filamento grueso formando hélices, en otras palabras una fracción de las cabezas de miosina no están disponibles (están "atrapadas") para interaccionar fácilmente con las moléculas de actina y solo el resto de ellas puede involucrarse rápidamente en el ciclo de los puentes cruzados. Por otra parte, cuando se incrementa la concentración de calcio, la calmodulina y la QCLM fosforila un cierto numero de cabezas de miosina, que son entonces "reclutadas" o liberadas de la superficie del filamento grueso, permitiendo que un numero mayor de cabezas de miosina este disponible para la producción de fuerza, permitiendo una modulación de la fuerza total producida por el músculo.
Nuestros logros científicos se pueden resumir en:
 1.- Visualización de filamentos gruesos de músculo estriado en estado congelado-hidratado en el crio-microscopio electrónico.
 2.- Desarrollo de un método computarizado para el ajuste de las coordenadas atómicas de la molécula de miosina a las densidades del mapa tridimensional del filamento grueso de músculo estriado. Refinación de dicho modelo contra del patrón de difracción de rayos-X correspondiente.
 3.- Determinación del modelo atómico de los filamentos gruesos de músculo estriado mediante el ajuste visual de las coordenadas atómicas de cabezas la molécula de miosina a la envolvente del mapa tridimensional de filamentos gruesos obtenido por Microscopía Electrónica.
 4.- Desarrollo de una técnica de enfriamiento rápido que permite congelar músculos vivos en plena contracción en menos de 2 milisegundos, en instantes predeterminados del twitch o tétano. Dicha técnica puede ser utilizada además con músculos desmembranados y en contracción inducida por difusión de Ca++.
 5.- Demostración por vez primera de que con dicha técnica es posible preservar la estructura en hélice de los filamentos gruesos en músculos vivos o desmembranados en estado relajado. 
 6.- Determinación de la reconstrucción tridimensional de filamentos gruesos preservados con dicha técnica.
 7.- Determinación directa de la simetría rotacional de filamentos gruesos de músculo de artrópodo preservados con dicha técnica.
 8.- Establecer con dicha técnica la existencia de cambios estructurales en las cabezas de miosina que están situadas en la zona-H entre músculo relajado y en rigor.
 9.- Establecer por Microscopía Electrónica que al fosforilar la cadenas ligeras regulatorias de las cabezas de miosina de músculo de tarántula, estas se despegan del esqueleto del filamento y se desordenan o se mueven hacia afuera, en preparación para la contracción.
 10.- Establecer por difracción de rayos-X que dicho cambio ocurre por un movimiento de las cabezas de miosina 6 nm hacia afuera del esqueleto.
 11.- Desarrollar un método rápido de purificación de miosina de artrópodo. 
 12.- Establecer la subestructura del esqueleto del filamento grueso de invertebrados.
 13.- Establecer la simetría rotacional de filamentos gruesos de bivalvo de manera directa por enfriamiento rápido.
 14.- Desarrollo de un método de substitución bajo congelamiento para tejido muscular preservado por enfriamiento rápido.
 15.- Establecer mediante microscopía electrónica y análisis y reconstrucción tridimensional de imágenes el arreglo y la orientación espacial de ambas cabezas de cada molécula de miosina de los filamentos gruesos de músculo en el estado relajado, lo cual ha permitido postular la explicación del proceso de activación de los filamentos gruesos basada en la fosforilación de las cadenas ligeras regulatorias de las cabezas de miosina: en el estado relajado ocurre una interacción entre cabezas de miosina axialmente contiguas, que mantiene al arreglo de puentes de miosina ordenadamente pegado al esqueleto del filamento - como un cierre de cremallera - evitando su interacción con las moléculas de actina vecinas; al ser fosforiladas las cadenas ligeras regulatorias la interacción entre moléculas de miosina desaparece, por lo cual las cabezas de miosina se despegan del esqueleto del filamento, listas para interactuar con las moléculas de actina produciendo la contracción muscular. 
 16.- Establecer por difracción de rayos-x que la orientacion del eje largo de la molecula asimetrica de actina esta orientado perpendicularmente al eje del filamento, lo cual tiene implicaciones en el mecanismo molecular de la contraccion muscular, a nivel de la interfase miosina-actina.
 17.- Establecer por difracción de rayos-x la estructura de un estado intermedio del ciclo de los puentes de miosina de la contraccion muscular, específicamente que solo el dominio de la cola de la cabeza de la molécula de miosina sufre cambios conformacionales entre el estado inicial de enlace a actina y el final del golpe de potencia, mientras que el dominio cercano a la actina no sufre cambios. Esta información permite discriminar entre diversos modelos de contracción muscular, ya que circunscribe los cambios estructurales a una región intra-dominio de la cabeza de miosina

Modelo atómico de filamento grueso de músculo.


Publicaciones selectas:

1.- Egelman, E.H. & Padrón, R. "X-ray diffraction evidence that actin is a 100 Å filament. 
 Nature, 307: 56-58, 1984.
2.- Padrón, R. y Huxley, H.E. The effect of the ATP analogue AMPPNP on the structure of crossbridges in vertebrate skeletal muscle: X-ray diffraction and mechanical studies. 
 J. Muscle Res. Cell. Motil 5(6): 613-655, 1984.
3.- Crowther, R.A.; Padrón, R. y Craig, R.: The arrangement of the heads of myosin in relaxed thick filaments from Tarántula muscle.
 J. Mol. Biol. 184(3): 429-439, 1985.
4.- Craig, R., Padrón, R. y Kendrick-Jones: Structural changes accompanying phosphorylation of tarántula muscle thick filaments. 
 J. Cell. Biol. 105: 1319-1327, 1987.
5.- Padrón, R. y Craig, R. Disorder induced in non-overlap myosin crossbridges by loss of adenosine triphosphate. 
 Biophys. J. 56: 927-933, 1989.
6.- Padrón, R., Panté, N., Sosa, H. & Kendrick-Jones, J. X-ray diffraction study of the structural changes accompanying phosphorylation of tarántula muscle. 
 J. Muscle Res. Cell Motil. 12(3): 235-241, 1991.
7.- Craig, R., Padrón, R. & Alamo, L. Direct determination of myosin filament symmetry in scallop striated adductor muscle by rapid freezing and freeze-substitution. 
 J. Mol. Biol. 220: 125-132,1991. 
8.- Craig, R., Alamo, L. & Padrón, R. Structure of the myosin filaments of relaxed and rigor striated vertebrate muscle studied by rapid freezing electron microscopy. 
 J. Mol. Biol. 228: 474-487, 1992.
9.- Padrón, R., Alamo, L., Guerrero, J. R., Granados, M., Uman, P. y Craig, R. Three-dimensional reconstruction of thick filaments from rapidly frozen, freeze-substituted tarántula muscle. 
 J. Struct. Biol.: 115(3): 250-257, 1995. 
10.- Padrón, R.; Alamo, L.; Murgich, J. & Craig, R. Towards an atomic model of the thick filament of muscle. 
 J. Mol. Biol. 275: 35-41, 1998.
11.- Offer, G.; Knight, P.; Burgess, S. A. Alamo, L. y Padrón, R. A new model for the surface arrangement of myosin molecules in heads in tarantula thick filaments.
J. Mol. Biol. 298: 239-260, 2000.
12.- Hidalgo, C., Craig, R., Ikebe, M. y Padrón, R. Mechanism of phosphorylation of the regulatory light chain of myosin from tarantula striated muscle.
J. Muscle Res. Cell Motil. 22. 51-59, 2001.
13 .- Luther, P.K. , Padrón, R., Ritter, S, Craig, R. y Squire, J. M. Heterogeneity of Z-band structure within a single muscle sarcomere: Implications for sarcomere assembly.
J. Mol. Biol. 332: 161-169, 2003.
14.- Craig, R. y Padrón, R. "Molecular Structure of the Sarcomere. Capitulo 7. pag.129-166. Libro de texto "Myology" (Editores A. G. Engel y C. Franzini-Armstrong), Tercera edición. McGraw-Hill, Inc., Nueva York. 2004. (Capitulo de revision por invitación)
15.- Zoghbi, M. E., Woodhead, J., Craig, R. y Padrón, R. Helical order in tarantula thick filaments requires the closed conformation of the myosin head.
J. Mol. Biol. 342: 1223-1236, 2004
16 .- J. Woodhead, F. Zhao, R. Craig, E. Egelman, L. Alamo y R.Padrón, Atomic model of a myosin filament in the relaxed state.
Nature 436: 1195-1199 , 2005.
17 .- F. Q. Zhao, R. Padrón & R. Craig. Blebbistatin stabilizes the helical order of myosin filaments by promoting the switch 2 closed state.
Biophys. J. 95: 3322-3329, 2008.

Dr. Raúl Padrón, Jefe del Departamento de Biología Estructural del IVIC. El Dr. Padrón es International Research Scholar de la Howard Hughes Medical Institute de los EE.UU. (Septiembre 1999, Foto Ricardo Barbato).